Le drapeau de Rurutu, hissé lors de la cérémonie d’ouverture des jeux inter-îles des Australes en 2000, est divisé en deux bandes horizontales, l’une blanche en haut et l’autre rouge en bas. Une petite bande bleue de la taille de la moitié de la longueur du drapeau est posée sur la bande rouge et porte l’inscription RURUTU en majuscules en lettres blanches.
Ce drapeau est semblable au vieux drapeau de Rurutu avant le Protectorat français. Lors de ce Protectorat de 1858 à 1889, par contre le drapeau de Rurutu, comportait en plus le drapeau national français dans le coin supérieur gauche (photo 2)

Le décret du Gouvernement du 4 décembre 1985 stipule que les pavillons des archipels et îles de Polynésie française peuvent être hissés à côté des drapeaux Territoriaux et Nationaux.